Glossaire du jardin scientifique

Les mots que nous employons dans nos pages science, définis simplement et reliés à leur source. Pathologie végétale, protection des cultures, science du sol et lecture d’une étude.

Pourquoi ce glossaire

Une étude ne sert à rien si le lecteur bute sur trois mots par paragraphe. Nous employons donc un vocabulaire précis, et nous le définissons ici, une fois pour toutes. Chaque entrée indique d’où vient la définition, et ce que le terme ne dit pas.

Aucune définition de cette page n’est recopiée d’un document extérieur : les notions sont reformulées avec nos mots, et la source est citée avec ses auteurs, son laboratoire et son identifiant. La façon dont nous lisons une étude est décrite sur la page Sources et méthode. Les données chiffrées du jardin français sont rassemblées sur la page Chiffres du jardin en France.

Deux familles de sources alimentent les entrées ci-dessous. D’une part les fiches Tropilég d’Ephytia, l’outil de diagnostic phytosanitaire d’INRAE rédigé par D. Blancard. D’autre part le Dictionnaire d’agroécologie d’INRAE, pour tout ce qui touche au sol et à la protection des cultures. Ces deux sources sont protégées par le droit d’auteur ou publiées sous une licence qui interdit les œuvres dérivées : nous les citons, nous ne les recopions pas.

Les maladies et leurs champignons

Oïdium: Maladie qui se reconnaît à une poudre blanche posée sur les parties aériennes, surtout les feuilles. Le champignon est le plus souvent installé à la surface de la plante, où il enfonce des suçoirs pour se nourrir, sans pénétrer dans les tissus : c’est un parasite obligatoire, qui ne se développe pas hors d’une plante hôte. Quelques oïdiums font exception et colonisent l’intérieur des tissus.Source : fiche Tropilég « Oïdiums », D. Blancard, INRAE, mise à jour du 14 février 2020.
Mildiou: Maladie due à des organismes classés parmi les oomycètes, et non parmi les vrais champignons. Leur mycélium progresse à l’intérieur des tissus de la feuille. Les taches s’étendent vite, et l’attaque peut gagner les tiges puis les fruits.Source : fiche Tropilég « Mildious », D. Blancard, INRAE, mise à jour du 4 décembre 2023.
Oomycète: Groupe d’organismes qui rassemble plus de huit cents espèces, vivant de matière organique en décomposition ou en parasites. Longtemps rangés avec les champignons, ils en ont été séparés après l’étude de leur structure fine et de leur biochimie. Les mildious en font partie, comme les Pythium et les agents des rouilles blanches.Source : fiche Tropilég « Mildious », D. Blancard, INRAE.
Mycélium: Filaments par lesquels le champignon occupe son support. Leur position sépare les deux grandes maladies du feuillage : chez l’oïdium, le mycélium se développe à la surface des organes aériens ; chez le mildiou, il évolue à l’intérieur du tissu de la feuille.Source : fiches Tropilég « Oïdiums » et « Mildious », INRAE.
Conidie: Spore asexuée de l’oïdium. Elle se forme à l’extrémité de filaments courts, les conidiophores, et se détache souvent en chaînes. Aucune fécondation n’intervient : c’est par elle que la maladie se multiplie au fil de la saison.Source : fiche Tropilég « Oïdiums », D. Blancard, INRAE.
Cléistothèce (chasmothèce): Forme sexuée de certains oïdiums, observée bien plus rarement que les conidies. La fiche d’origine emploie le terme de cléistothèce ; le mot chasmothèce, rencontré ailleurs, désigne le même organe.Source : fiche Tropilég « Oïdiums », D. Blancard, INRAE.
Oospore: Forme issue de la reproduction sexuée du mildiou, et rarement observée au champ.Source : fiche Tropilég « Mildious », D. Blancard, INRAE.
Sporange: Organe qui contient et libère les spores asexuées du mildiou. Il est porté par un filament, le sporangiophore, qui traverse la surface de la feuille en passant par un stomate. Deux suites sont alors possibles : le sporange germe sur place, ou bien il libère des spores mobiles, capables de nager dans le film d’eau qui recouvre une feuille mouillée.Source : fiche Tropilég « Mildious », D. Blancard, INRAE.
Parasite obligatoire: Organisme qui ne peut se développer qu’aux dépens d’un hôte vivant, et qui ne se cultive donc pas sur un milieu artificiel. L’oïdium et le mildiou sont dans ce cas.Source : fiches Tropilég « Oïdiums » et « Mildious », INRAE.

Protéger les cultures

Biocontrôle: Protection qui s’appuie sur le vivant plutôt que sur la chimie de synthèse : on se sert d’êtres vivants, ou de produits tirés de la nature, pour empêcher les nuisibles de faire des dégâts ou pour en limiter l’ampleur. La réglementation européenne y range quatre familles de moyens : les animaux et autres grands organismes, les micro-organismes, les phéromones et les messagers chimiques, et enfin les substances d’origine naturelle, qu’elles viennent d’une plante, d’un animal ou d’un minéral.Source : Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, M. Busson, J. Chetty, M.-H. Robin, J.-N. Aubertot, DOI 10.17180/z4qt-5r85.
Auxiliaire de culture: Être vivant dont la présence rend service à une culture, au point de remplacer une part du travail ou des apports du jardinier. Le mot couvre large : un oiseau qui mange des limaces, un insecte qui pollinise, un champignon du sol qui s’attaque à un ravageur. Pris au sens étroit, il désigne les ennemis naturels des nuisibles. La source les répartit en trois groupes : les prédateurs, les parasitoïdes, et les micro-organismes parasites.Source : Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, C. Joseph, D. Delattre, J.-P. Sarthou, DOI 10.17180/9z65-4m22.
Régulation biologique: Ce qui, dans un jardin, ramène les choses vers l’équilibre sans intervention directe : les uns mangent les autres, les fleurs se font polliniser, les populations cessent de s’emballer. Elle peut se produire d’elle-même après un dérangement, ou bien découler des choix du jardinier, qui oriente alors le milieu vers le seuil qu’il s’est fixé.Source : Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, A. Sagorin, A. Perrin, J.-P. Sarthou, DOI 10.17180/zahx-0883.
Lutte biologique par conservation: Stratégie de protection qui mise sur les auxiliaires déjà installés alentour, au lieu d’en apporter de nouveaux. On aménage le milieu pour qu’ils trouvent de quoi se nourrir et se reproduire en toute saison, car une culture seule ne suffit jamais à couvrir tout leur cycle : il leur faut des ressources d’appoint, de même nature et de nature différente. C’est la déclinaison par le milieu de la protection intégrée.Source : Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, A. Rousseaux, L. Seychal, J.-P. Sarthou, DOI 10.17180/s4kq-dy18.
Culture associée: Faire pousser ensemble, sur une même planche et pendant l’essentiel de leur croissance, au moins deux espèces différentes. L’idée est que deux plantes n’exploitent pas le milieu de la même façon : en les mélangeant, on tire davantage du sol et de la lumière, et on complique la tâche des maladies, des ravageurs et des herbes indésirables.Source : Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, L. Bedoussac, E.-P. Journet, DOI 10.17180/0h8x-a774.
Engrais vert: Cultures que l’on sème pour le sol et non pour la récolte. Elles occupent la parcelle entre deux productions, ou bien à côté de la précédente, et l’azote qu’elles ont capté profitera à la suivante. Leurs racines travaillent la structure du sol, et leur décomposition laisse derrière elle un peu de matière organique durable.Source : Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, M. Thromas, P. Bompard, S. Giuliano, DOI 10.17180/7sa0-6527.

Le sol vivant

Vie du sol: Tout ce qui habite la terre et sa surface, au moins pendant une partie de son existence : vers, insectes, champignons, bactéries. Ces organismes ne font pas que loger là, ils fabriquent le sol et l’entretiennent, et leurs échanges avec les plantes favorisent la pousse. Un sol n’est d’ailleurs qu’une petite part de matière organique, entre un et sept pour cent, mêlée à une large majorité de minéraux.Source : Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, J.-P. Sarthou, DOI 10.17180/jwg3-ep28.
Santé des sols: Idée qu’un sol peut aller bien ou mal, comme un organisme : un sol en bonne santé produit de la végétation sans cesser d’être un milieu vivant, et il rend au passage des services à l’air, à l’eau et à la biodiversité. Cette façon de voir s’est construite dans les années 2000, en plaçant la biologie au premier plan, alors que la notion de qualité des sols dominait dans les années 1990.Source : Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, J.-P. Sarthou, DOI 10.17180/r87s-bd84.
Fertilité biologique des sols: Part de la fertilité d’un sol qui doit tout au vivant : ce sont les organismes qui décomposent les débris de plantes et d’animaux, et libèrent ainsi l’azote, le phosphore et le potassium dont la culture se servira. Toute la matière organique ne part pas en même temps : la part la plus tendre nourrit les microbes du sol, qui à leur tour nourrissent les plantes, tandis que la part la plus résistante donne au sol sa structure. Ce sont ces deux destins qu’il faut tenir en équilibre.Source : Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, M. Delahaie, M. Boissières, S. Giuliano, L. Bedoussac, L. Alletto, DOI 10.17180/p8se-5240.
Allélopathie: Façon dont les plantes communiquent par la chimie, entre elles comme avec les micro-organismes du milieu. Le mot vient du grec et portait au départ l’idée de nuisance : une plante gêne sa voisine, ou se défend contre elle. L’usage a depuis englobé les effets favorables, quand une plante stimule les microbes du sol ou en aide une autre. Les molécules en cause, très diverses, sortent par les racines ou par les parties aériennes.Source : Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, C. Aubertin, M. Archambeau, J.-P. Sarthou, DOI 10.17180/xzn2-5d05.
Couverture végétale permanente: Principe qui consiste à ne jamais laisser une terre nue : à peine une culture finie, une autre prend sa place, choisie pour ce qu’elle apporte au sol. Encore faut-il que ce couvert de l’entre-deux saisons soit adapté à la parcelle, à la période et au matériel dont on dispose, et surtout qu’on laisse sur place ce qu’il a produit. C’est à ce prix que le stock de matière organique progresse et que la structure du sol s’améliore.Source : Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, F. Loubes, V. Brasiles, J.-P. Sarthou, DOI 10.17180/qa1a-q259.
Services écosystémiques: Ce que la nature rend aux sociétés humaines, directement ou non : de quoi se nourrir, de l’eau propre, un paysage agréable. L’expression est née du dialogue entre l’économie et l’écologie, et suppose donc qu’on puisse chiffrer la nature, souvent en euros. Cette hypothèse est discutée, et certains y voient surtout un moyen de rendre visibles les liens entre les humains et leur milieu.Source : Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, C. Sirami, J.-P. Theau, J. Ryschawy, DOI 10.17180/g1qe-4s49.

Lire une étude : nos quatre niveaux de preuve

Chaque étude reprise sur le site porte un badge, et ce badge veut dire quelque chose. Les quatre niveaux ci-dessous vont du plus solide au plus faible. Le badge n’est jamais affiché seul : sa définition et sa limite l’accompagnent toujours, parce qu’un niveau de preuve sans sa limite devient un argument publicitaire.

Méta-analyse: Plusieurs études indépendantes sur la même question sont rassemblées et traitées statistiquement comme une seule. C’est ce qui se fait de plus solide pour dire qu’un effet existe en moyenne.Limite : Une moyenne ne décrit aucun jardin en particulier. Elle peut même cacher deux résultats opposés selon l’espèce, le sol ou le climat.
Essai contrôlé: Un protocole compare un lot témoin et un lot traité, dans les mêmes conditions et sur la même durée. C’est ce qui permet d’attribuer un effet au facteur testé plutôt qu’au hasard.Limite : Le résultat vaut pour l’espèce, le sol et la durée testés. Une saison d’essai ne dit rien d’un effet au bout de cinq ans.
Observation: Un constat de terrain ou de suivi, sans lot témoin. Utile pour repérer une piste et formuler une hypothèse.Limite : Un autre facteur peut expliquer le résultat. Nous la traitons comme une piste, jamais comme une preuve.
Avis d’expert: Une pratique recommandée par des professionnels ou des institutions, sans protocole expérimental publié.Limite : C’est de l’expérience accumulée, pas une mesure. C’est le plus faible de nos niveaux, et nous l’affichons comme tel.

Ces quatre définitions sont affichées telles quelles à partir du même fichier que le badge et que la page Sources et méthode. Elles ne sont jamais recopiées ailleurs, pour qu’une correction n’ait qu’un seul endroit à toucher.

Sources

Ephytia, INRAE, fiche Tropilég « Oïdiums », D. Blancard, mise à jour du 14 février 2020
Ephytia, INRAE, fiche Tropilég « Mildious », D. Blancard, mise à jour du 4 décembre 2023
Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, M. Busson, J. Chetty, M.-H. Robin, J.-N. Aubertot, DOI 10.17180/z4qt-5r85
Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, C. Joseph, D. Delattre, J.-P. Sarthou, DOI 10.17180/9z65-4m22
Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, A. Sagorin, A. Perrin, J.-P. Sarthou, DOI 10.17180/zahx-0883
Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, A. Rousseaux, L. Seychal, J.-P. Sarthou, DOI 10.17180/s4kq-dy18
Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, L. Bedoussac, E.-P. Journet, DOI 10.17180/0h8x-a774
Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, M. Thromas, P. Bompard, S. Giuliano, DOI 10.17180/7sa0-6527
Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, J.-P. Sarthou, DOI 10.17180/jwg3-ep28
Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, J.-P. Sarthou, DOI 10.17180/r87s-bd84
Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, M. Delahaie, M. Boissières, S. Giuliano, L. Bedoussac, L. Alletto, DOI 10.17180/p8se-5240
Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, C. Aubertin, M. Archambeau, J.-P. Sarthou, DOI 10.17180/xzn2-5d05
Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, F. Loubes, V. Brasiles, J.-P. Sarthou, DOI 10.17180/qa1a-q259
Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, C. Sirami, J.-P. Theau, J. Ryschawy, DOI 10.17180/g1qe-4s49

Les fiches Ephytia sont protégées par le droit d’auteur, et le Dictionnaire d’agroécologie est publié sous licence Creative Commons Attribution, pas d’utilisation commerciale, pas de modification 3.0 France. Dans les deux cas, nous reprenons les notions en les reformulant entièrement, sans recopier de texte ni de figure, et nous citons les auteurs, le laboratoire et l’identifiant de la publication. Les définitions de cette page sont les nôtres : elles n’engagent pas leurs auteurs.

Dernière vérification des sources : 21 septembre 2026. Un terme employé dans une page du site et absent d’ici peut être signalé depuis la page Contact.

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Pourquoi ce glossaire

Le sol vivant

Vie du sol: Tout ce qui habite la terre et sa surface, au moins pendant une partie de son existence : vers, insectes, champignons, bactéries. Ces organismes ne font pas que loger là, ils fabriquent le sol et l’entretiennent, et leurs échanges avec les plantes favorisent la pousse. Un sol n’est d’ailleurs qu’une petite part de matière organique, entre un et sept pour cent, mêlée à une large majorité de minéraux.Source : Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, J.-P. Sarthou, DOI 10.17180/jwg3-ep28.
Santé des sols: Idée qu’un sol peut aller bien ou mal, comme un organisme : un sol en bonne santé produit de la végétation sans cesser d’être un milieu vivant, et il rend au passage des services à l’air, à l’eau et à la biodiversité. Cette façon de voir s’est construite dans les années 2000, en plaçant la biologie au premier plan, alors que la notion de qualité des sols dominait dans les années 1990.Source : Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, J.-P. Sarthou, DOI 10.17180/r87s-bd84.
Fertilité biologique des sols: Part de la fertilité d’un sol qui doit tout au vivant : ce sont les organismes qui décomposent les débris de plantes et d’animaux, et libèrent ainsi l’azote, le phosphore et le potassium dont la culture se servira. Toute la matière organique ne part pas en même temps : la part la plus tendre nourrit les microbes du sol, qui à leur tour nourrissent les plantes, tandis que la part la plus résistante donne au sol sa structure. Ce sont ces deux destins qu’il faut tenir en équilibre.Source : Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, M. Delahaie, M. Boissières, S. Giuliano, L. Bedoussac, L. Alletto, DOI 10.17180/p8se-5240.
Allélopathie: Façon dont les plantes communiquent par la chimie, entre elles comme avec les micro-organismes du milieu. Le mot vient du grec et portait au départ l’idée de nuisance : une plante gêne sa voisine, ou se défend contre elle. L’usage a depuis englobé les effets favorables, quand une plante stimule les microbes du sol ou en aide une autre. Les molécules en cause, très diverses, sortent par les racines ou par les parties aériennes.Source : Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, C. Aubertin, M. Archambeau, J.-P. Sarthou, DOI 10.17180/xzn2-5d05.
Couverture végétale permanente: Principe qui consiste à ne jamais laisser une terre nue : à peine une culture finie, une autre prend sa place, choisie pour ce qu’elle apporte au sol. Encore faut-il que ce couvert de l’entre-deux saisons soit adapté à la parcelle, à la période et au matériel dont on dispose, et surtout qu’on laisse sur place ce qu’il a produit. C’est à ce prix que le stock de matière organique progresse et que la structure du sol s’améliore.Source : Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, F. Loubes, V. Brasiles, J.-P. Sarthou, DOI 10.17180/qa1a-q259.
Services écosystémiques: Ce que la nature rend aux sociétés humaines, directement ou non : de quoi se nourrir, de l’eau propre, un paysage agréable. L’expression est née du dialogue entre l’économie et l’écologie, et suppose donc qu’on puisse chiffrer la nature, souvent en euros. Cette hypothèse est discutée, et certains y voient surtout un moyen de rendre visibles les liens entre les humains et leur milieu.Source : Dictionnaire d’agroécologie, INRAE, C. Sirami, J.-P. Theau, J. Ryschawy, DOI 10.17180/g1qe-4s49.